晴朗时节，江户川柯南（高山南配音）和毛利小五郎（小山力也配音）、小兰（山崎和佳奈配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美配音）、阿笠博士（绪方贤一配音）、服部平次（堀川亮配音）以及远山和叶（宫村优子配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量……
弗莱迪·海默/休·劳瑞/斯蒂芬·弗雷/托比·琼斯/艾美达·斯丹顿/MirandaHart
梶裕贵/三泽纱千香/丰崎爱生/浅沼晋太郎/户松遥/铃村健一
卡洛斯·阿拉斯拉奇/GregLastrapes/ScarletLastrapes/塔拉·斯特朗/JimWard
詹姆斯·柯登/多姆纳尔·格里森/罗丝·伯恩/伊丽莎白·德比茨基/玛格特·罗比/黛西·雷德利/科林·穆迪/山姆·尼尔/希雅/伊文·莱斯利/费萨尔·巴齐/克里斯蒂安·加扎尔/玛丽安娜·琼-巴普蒂斯特/加雷斯·戴维斯/山姆·哈夫特/萨莎·霍勒/娜塔丽·朱/特伦尼娅·爱德华兹/费利克斯·威廉森/许明珠/布莱恩·布朗/蕾切尔·沃德/大卫·文翰/威尔·赖歇尔特
汤姆·麦格拉思,约翰·迪·马吉欧,比尔·法格巴克,霍利·多夫,里夫·霍顿,霍普·利维
宫野真守,玉川纱己子,小野大辅,斋藤千和
栗田贯一,小林清志,井上真树夫,增山江威子,纳谷悟朗,银河万丈
松井菜樱子,藤田淑子,高岛雅罗,鹤广美
未知
松井菜樱子,藤田淑子,冈本麻弥,鹤广美
更新至03集完结
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